{"id":1261,"date":"2016-07-01T10:03:55","date_gmt":"2016-07-01T08:03:55","guid":{"rendered":"http:\/\/drsalumni.unil.ch\/?page_id=1261"},"modified":"2021-03-23T12:03:49","modified_gmt":"2021-03-23T10:03:49","slug":"interview-with-armand-valsesia","status":"publish","type":"page","link":"http:\/\/drsalumni.unil.ch\/index.php\/alumni-interviews\/interview-with-armand-valsesia\/","title":{"rendered":"Armand Valsesia"},"content":{"rendered":"

Parcours de Drs Alumni: 60 minutes avec Armand Valsesia <\/u><\/strong><\/p>\n

Mon conseil\u00a0? Cultivez la curiosit\u00e9, et ne vous cantonnez pas \u00e0 des cours techniques ou dans votre zone de confort. Des formations sur la communication scientifique, l\u2019organisation du travail et les brevets sont utiles pour la carri\u00e8re future.<\/strong><\/p>\n

Date de naissance<\/u>: le 8 octobre 1981.
\nDate de la soutenance de th\u00e8se<\/u>: avril 2011.
\nTitre de la th\u00e8se<\/u>: Computational and statistical analysis of copy number variants in normal and cancer genomes.
\nDirecteur de th\u00e8se<\/u>: Prof Victor Jongeneel & Prof Sven Bergmann (co-directeur).
\nPoste actuel<\/u>: Project lead at Nestl\u00e9 Institute of Health Sciences.<\/p>\n

\u00a0<\/em><\/strong><\/p>\n

Drs Alumni Network:\u00a0<\/em><\/strong>Parlez-nous de vos \u00e9tudes en biologie\u00a0?
\n<\/strong>Armand Valsesia:<\/em><\/strong> La biologie est la mati\u00e8re o\u00f9 j\u2019\u00e9tais le plus fort au lyc\u00e9e; cela m\u2019a donn\u00e9 l\u2019envie d\u2019approfondir mes connaissances dans le domaine de la biologie cellulaire et mol\u00e9culaire \u00e0 l\u2019Universit\u00e9 de Bordeaux. A l\u2019\u00e9poque, la bio-informatique \u00e9tait un domaine qui \u00e9mergeait. Cela m\u2019a parl\u00e9, car j\u2019y trouvais de l’analyse appliqu\u00e9e \u00e0 de la biologie mol\u00e9culaire. C\u2019\u00e9tait l\u2019ann\u00e9e de la r\u00e9forme universitaire europ\u00e9enne avec l\u2019apparition des masters, j\u2019ai donc choisi cette fili\u00e8re-l\u00e0, que j\u2019ai compl\u00e9t\u00e9 avec des stages, \u00e0 l\u2019Institut europ\u00e9en de bio-informatique et au sein d\u2019un institut britannique de recherche, le Sanger.<\/p>\n

Le doctorat \u00e9tait une option. Pourquoi avoir voulu en effectuer un\u00a0?
\n<\/strong>En r\u00e9alit\u00e9, \u00e0 la fin de mon master, je ne d\u00e9sirais pas poursuivre avec une th\u00e8se de doctorat. Mon dipl\u00f4me m\u2019a permis de travailler en tant qu\u2019ing\u00e9nieur bio-informatique \u00e0 l\u2019EBI (European Bioinformatics Institute, ndlr), et ensuite en tant qu\u2019ing\u00e9nieur de recherche au Sanger. Ces exp\u00e9riences m\u2019ont donn\u00e9 l\u2019envie de mener une \u00e9tude plus pointue, et j\u2019ai senti que le PhD \u00e9tait une formation qui me manquait. C\u2019est donc deux ans apr\u00e8s que je me suis mis en qu\u00eate\u00a0d\u2019un laboratoire en Europe. Deux sujets de th\u00e8se \u00e0 l\u2019UNIL m\u2019int\u00e9ressaient particuli\u00e8rement: l\u2019un sur le th\u00e8me de l\u2019oncologie, avec le Prof. Victor Jongeneel (co- fondateur du SIB, l\u2019Institut suisse de bio-informatique), et l\u2019autre dans le domaine de la g\u00e9n\u00e9tique m\u00e9dicale, avec le Prof. Sven Bergmann. J\u2019ai finalement opt\u00e9 pour le premier. A mon arriv\u00e9e \u00e0 l\u2019UNIL, Victor m\u2019a annonc\u00e9 qu\u2019il avait accept\u00e9 des responsabilit\u00e9s \u00e0 Chypre, en tant que directeur d\u2019un nouvel institut de recherche. Afin d\u2019assurer le suivi de ma th\u00e8se entre ses d\u00e9placements Lausanne-Nicosie, celui-ci m\u2019a annonc\u00e9 que mon co-directeur de th\u00e8se serait Sven. J\u2019ai donc men\u00e9 ma th\u00e8se sur les deux sujets qui m\u2019int\u00e9ressaient! Ce fut une p\u00e9riode plut\u00f4t intense, mais j\u2019ai tellement appris que je ferais \u00e0 nouveau le m\u00eame choix.<\/p>\n

Pourriez-vous nous parler de ce que vous avez r\u00e9alis\u00e9 en parall\u00e8le \u00e0 vos \u00e9tudes\u00a0?
\n<\/strong>Au niveau associatif, j\u2019\u00e9tais tr\u00e8s impliqu\u00e9 \u00e0 l\u2019universit\u00e9, que ce soit en France (j\u2019\u00e9tais le pr\u00e9sident de l\u2019association des \u00e9tudiants en bio-informatique), et \u00e0 Lausanne (j\u2019\u00e9tais un membre actif de l\u2019ADAS, l\u2019association des doctorants et assistants de la FBM). C\u2019\u00e9tait tr\u00e8s enrichissant de comprendre le fonctionnent universitaire, et surtout, cela m\u2019a permis de rencontrer des gens d\u2019autres horizons. Tout au long de mes \u00e9tudes, j\u2019ai occup\u00e9 divers emplois alimentaires et effectu\u00e9 des stages pendant les vacances. Par exemple, pendant ma premi\u00e8re ann\u00e9e universitaire, je suis parti au Kosovo. Initialement, je voulais r\u00e9aliser ce stage dans les ONG \u00ab\u00a0Doctors of the World\u00a0\u00bb ou \u00ab\u00a0Pharmaciens Sans Fronti\u00e8res\u00a0\u00bb, qui sont en lien avec la m\u00e9dicine. Mais c\u2019\u00e9tait en 1999, juste apr\u00e8s le conflit du Kosovo. Ma s\u00e9curit\u00e9 ne pouvait donc pas \u00eatre garantie sur place. Les conditions se sont un peu am\u00e9lior\u00e9es, et je suis finalement parti avec l\u2019ONG \u00ab\u00a0Atlas Logistique\u00a0\u00bb en charge de la livraison de mat\u00e9riel de construction, scolaire et de m\u00e9dicaments. J\u2019ai aussi effectu\u00e9 d\u2019autres stages \u00ab\u00a0plus classiques\u00a0\u00bb, en laboratoire, en biologie mol\u00e9culaire \u00e0 Swansea (\u00e9change ERASMUS) et en neuroscience \u00e0 Bordeaux.<\/p>\n

Pendant vos \u00e9tudes \u00e0 l\u2019UNIL, quels \u00e9taient les services ou formations en place en mati\u00e8re de d\u00e9veloppement professionnel\u00a0?
\n<\/strong>Je trouve justement que l\u2019offre est bonne, que ce soit l\u2019UNIL, la CUSO (Conf\u00e9rence universitaire de Suisse occidentale, ndlr), le SIB ou l\u2019EPFL. Les douze cr\u00e9dits \u00e0 valider pendant la th\u00e8se sont, \u00e0 mon sens, un avantage pour tous les doctorants. J\u2019ai suivi plusieurs cours en dehors de ma sp\u00e9cialit\u00e9, pour justement approcher d\u2019autres champs de la bioinformatique. Je trouve que l\u2019UNIL propose beaucoup de formations \u00ab\u00a0soft skills\u00a0\u00bb<\/em>. Je garde en t\u00eate un atelier que j\u2019avais particuli\u00e8rement appr\u00e9ci\u00e9, sur l\u2019importance de la voix lors des pr\u00e9sentations, qui \u00e9tait anim\u00e9 par une cantatrice, et du cours de scientific writing,<\/em> indispensable \u00e0 une carri\u00e8re de scientifique. Je regrette d\u2019ailleurs ne pas avoir pris part \u00e0 d\u2019autres enseignements, comme par exemple, celui sur le th\u00e8me l\u2019enseignement universitaire ou ceux ax\u00e9s business.<\/p>\n

Vous \u00eates maintenant <\/strong>Project lead au Nestl\u00e9 Institute of Health Sciences<\/strong>. Pourquoi ce choix\u00a0?
\n<\/strong>Je n\u2019ai pas vraiment choisi, c\u2019est arriv\u00e9 un peu par hasard. Mon parcours a \u00e9t\u00e9 d\u00e9terminant pour que je devienne un project leader<\/em>. A la fin de ma th\u00e8se, j\u2019ai travaill\u00e9 chez Merck Serono, dans le domaine des essais cliniques allant des phases I \u00e0 IV, et c\u2019est justement cette exp\u00e9rience-l\u00e0 qui m\u2019a permis d\u2019\u00eatre embauch\u00e9 par Nestl\u00e9. J\u2019ai ensuite eu l\u2019occasion de faire mes preuves dans diff\u00e9rentes activit\u00e9s; et mon chef de d\u00e9partement m\u2019a confi\u00e9 la direction de projets plus ambitieux.<\/p>\n

Faites-nous d\u00e9couvrir votre m\u00e9tier\u00a0!
\n<\/strong>Ma mission est celle d\u2019int\u00e9grer les connaissances en biologie computationnelle dans le domaine du diab\u00e8te et de l\u2019ob\u00e9sit\u00e9. Je conduis l\u2019une des plus grandes \u00e9tudes d\u2019intervention, DiOGenes; il s\u2019agit d\u2019un ancien projet europ\u00e9en, dont l\u2019objectif est de comprendre les dynamiques de perte de poids chez des patients ob\u00e8ses afin de pr\u00e9dire les r\u00e9sultats cliniques: par exemple, quels seraient les patients ob\u00e8ses ayant le plus de chance de b\u00e9n\u00e9ficier de l\u2019intervention clinique. Dans ce contexte, il n\u2019est pas juste important de perdre du poids, mais aussi de diminuer d\u2019autres facteurs de risque, comme par exemple les maladies cardiovasculaires et le diab\u00e8te. Mon r\u00f4le est donc de d\u00e9finir la strat\u00e9gie du projet, de superviser les analyses des diff\u00e9rentes donn\u00e9es \u2018omiques\u2019 et cliniques, ainsi que de coordonner les analyses. Je suis aussi responsable de d\u00e9finir avec l\u2019\u00e9quipe les prochaines \u00e9tapes en lien avec l\u2019interpr\u00e9tation des r\u00e9sultats. Notre but n\u2019est pas seulement de pouvoir pr\u00e9dire la r\u00e9ponse \u00e0 l\u2019intervention, mais aussi de g\u00e9n\u00e9rer de nouvelles hypoth\u00e8ses qui pourraient personnaliser les traitements, et de mieux aider les patients.<\/p>\n

\u00a0<\/strong><\/p>\n

Parlez-nous de votre motivation\u2026
\n<\/strong>C\u2019est la d\u00e9couverte, le fait d\u2019apprendre des choses tous les jours. J\u2019ai la chance de pouvoir travailler avec des experts dans diff\u00e9rents domaines (g\u00e9nomique, lipidomique, physiologie, m\u00e9tabolisme, analyse de donn\u00e9es, IT…)\u00a0; j\u2019interagis au quotidien avec mes coll\u00e8gues de Nestl\u00e9, mes collaborateurs acad\u00e9miques et des consultants externes. De plus, j\u2019ai la chance de travailler sur des donn\u00e9es assez uniques, qui me permettent de formuler et de tester de nouvelles hypoth\u00e8ses.<\/p>\n

\u00a0<\/strong><\/p>\n

A votre avis, quelles sont les comp\u00e9tences n\u00e9cessaires pour mener \u00e0 bien une telle mission\u00a0?
\n<\/strong>Je dirais l\u2019organisation, c\u2019est-\u00e0-dire arriver \u00e0 classer les t\u00e2ches par ordre de priorit\u00e9. Les comp\u00e9tences techniques sont bien s\u00fbr importantes, mais ne suffisent pas. Par exemple, confront\u00e9 \u00e0 un probl\u00e8me, il faut \u00eatre capable d\u2019identifier une solution parmi plusieurs, et de l\u2019impl\u00e9menter rapidement; il n\u2019est pas souhaitable de passer des semaines \u00e0 tester toutes les solutions possibles. Un autre aspect est la communication. Nous travaillons avec des personnes qui ne sont pas des scientifiques; je pense aux avocats, \u00e0 des gestionnaires de contrats, et \u00e0 des personnes plus orient\u00e9es business. Il est donc tr\u00e8s important de vulgariser ses propos, en mettant en avant l\u2019\u00e9l\u00e9ment qui a un int\u00e9r\u00eat pour l\u2019interlocuteur, sans se perdre dans les d\u00e9tails.<\/p>\n

\u00a0<\/strong><\/p>\n

Pensez-vous que d\u2019autres institutions sont \u00e0 la recherche de profils comme le v\u00f4tre\u00a0?
\n<\/strong>Je l\u2019esp\u00e8re\u00a0! On pourrait qualifier mon profil de data scientist<\/em>. Il est relativement versatile, et, par cons\u00e9quent, extr\u00eamement recherch\u00e9 dans le domaine de la m\u00e9decine personnalis\u00e9e, plut\u00f4t au sein d\u2019un contexte industriel, qu\u2019universitaire ou institutionnel. J\u2019ai \u00e9galement d\u00e9velopp\u00e9 d\u2019autres comp\u00e9tences, comme par exemple la gestion de projet qui s\u2019applique \u00e0 beaucoup d\u2019autres carri\u00e8res.<\/p>\n

\u00a0<\/strong><\/p>\n

Justement, en quoi votre doctorat vous a-t-il aid\u00e9\u00a0?
\n<\/strong>Le doctorat a \u00e9t\u00e9 un \u00e9norme plus! Quand j\u2019ai commenc\u00e9 ma th\u00e8se, je ne pensais pas en apprendre autant. J\u2019ai r\u00e9alis\u00e9 que l\u2019on pense parfois conna\u00eetre son sujet\u2026 mais qu\u2019il reste en fait tellement \u00e0 d\u00e9couvrir\u00a0! En discutant avec des scientifiques ayant plus de vingt ans de recherche derri\u00e8re eux, j\u2019ai pris conscience qu\u2019il y a toujours un savoir \u00e0 acqu\u00e9rir, qu\u2019il soit scientifique, technique, ou au niveau des soft skills. D\u2019ailleurs, mes premi\u00e8res pr\u00e9sentations \u00e9taient vraiment catastrophiques. Avec plus de 50 slides, je me perdais dans les d\u00e9tails. Le doctorat m\u2019a appris \u00e0 aller \u00e0 l\u2019essentiel. C\u2019est cela qui me permet de g\u00e9rer une grande charge de travail, de mani\u00e8re organis\u00e9e, sur une dur\u00e9e de travail limit\u00e9e.<\/p>\n

Que conseilleriez-vous \u00e0 un \u00e9tudiant PhD en mati\u00e8re de d\u00e9veloppement?
\n<\/strong>En premier lieu\u00a0: ne pas faire un plan sur dix ans, mais plut\u00f4t anticiper la direction que l\u2019on veut prendre sur deux ou trois ans. Il est avant tout fondamental de se poser les bonnes questions assez t\u00f4t, car il y a des choix de vie derri\u00e8re. Il est aussi important de ne pas chercher la solution de facilit\u00e9 en disant\u00a0: \u00ab\u00a0Je prolonge ma th\u00e8se d\u2019une ann\u00e9e.\u00a0\u00bb, ou encore, \u00ab\u00a0Je d\u00e9bute un post-doc dans un rayon de trois km, car j\u2019ai peur de voyager.\u00bb. Le deuxi\u00e8me aspect, c\u2019est d\u2019\u00eatre ouvert. J\u2019ai le regret de ne pas avoir suivi suffisamment de cours pendant mon PhD. On est parfois trop stress\u00e9 \u00e0 cause de la pression, de la charge de travail ou de l\u2019envie de publier. Peut-\u00eatre qu\u2019on ne sort pas assez de sa zone de confort ou d\u2019expertise, ce qui est \u00e0 mon sens dommage. S\u2019adapter \u00e0 d\u2019autres situations, nous permet d\u2019\u00e9ventuellement partir dans une autre direction. Mon conseil\u00a0? Cultivez la curiosit\u00e9, et ne vous cantonnez pas \u00e0 des cours techniques ou dans votre zone de confort. Des formations sur la communication scientifique, l\u2019organisation du travail et les brevets sont utiles pour la future carri\u00e8re. <\/strong>Dans cette profession, il est essentiel d\u2019apprendre \u00e0 vulgariser son travail.<\/p>\n

\u00a0<\/strong><\/p>\n

Quelles sont les personnes qui ont marqu\u00e9 votre parcours professionnel\u00a0?
\n<\/strong>Il y en a vraiment beaucoup\u00a0! Mes directeurs de th\u00e8se \u00e9videmment, mais aussi toutes les personnes que j\u2019ai rencontr\u00e9es au sein des laboratoires. Je pense notamment \u00e0 Merck, o\u00f9 j\u2019ai obtenu une place de r\u00eave. Je sortais \u00e0 peine de la th\u00e8se, et je suis tomb\u00e9 sur une \u00e9quipe de cinq personnes, avec vingt ans de pharma derri\u00e8re elles, et qui d\u00e9tenaient toutes des PhD et des exp\u00e9riences post-doctorales. J\u2019ai trouv\u00e9 cela g\u00e9nial, le fait d\u2019arriver au sein d\u2019un groupe o\u00f9 il n\u2019y avait pas de comp\u00e9tition, avec des t\u00e2ches claires et des managers qui planifiaient tout \u00e0 l\u2019avance. Je me rappelle de ma premi\u00e8re semaine, deux de mes coll\u00e8gues Marc et Alessandro m\u2019ont dit \u00ab\u00a0Tu ne connais pas ce langage de programmation, ce n\u2019est pas grave. On va te mettre le pied \u00e0 l\u2019\u00e9trier, et dans deux semaines tu seras pr\u00eat.\u00a0\u00bb. L\u2019ambiance \u00e9tait \u00e9panouissante, on apprenait les uns des autres; je ne les remercierai jamais suffisamment, car ce sont eux qui m\u2019ont aid\u00e9 \u00e0 grandir.<\/p>\n

Cultivez-vous un hobby\u00a0?
\n<\/strong>J\u2019ai un peu moins de temps pour les hobbies maintenant (Armand Valsesia vient de devenir papa, ndlr.). Mon grand hobby est la gastronomie et son partage\u00a0; je suis un grand passionn\u00e9 de cuisine, j\u2019adore inviter des amis. J\u2019aime \u00e9galement aller au restaurant et go\u00fbter diff\u00e9rentes sp\u00e9cialit\u00e9s. La d\u00e9couverte de vins provenant du monde entier est une autre de mes passions.<\/p>\n

Quel est votre lieu pr\u00e9f\u00e9r\u00e9 \u00e0 l\u2019UNIL\u00a0?
\n<\/strong>J\u2019appr\u00e9cie \u00e9norm\u00e9ment le G\u00e9nopode, et ai eu le temps de voir passer les saisons\u2026 Je regrette ne pas avoir pris une photo \u00e0 chaque fois que je rentrais dans le b\u00e2timent, avec la vue sur les montagnes et le lac. J\u2019aurais pu faire un magnifique reportage des quatre saisons!<\/p>\n

Quel est le cours donn\u00e9 \u00e0 l\u2019UNIL auquel vous souhaiteriez retourner demain\u00a0?
\n<\/strong>J\u2019ai bien aim\u00e9 les cours de Damian Conway, professeur d\u2019informatique, qui a d\u00e9velopp\u00e9 un langage de programmation. En r\u00e9alit\u00e9, il est un showman. R\u00e9guli\u00e8rement sur invitation du SIB, il donne un cours technique au sujet de la mani\u00e8re de pr\u00e9senter. Il commence avec une fausse prise d\u2019a\u00efkido entre lui et une personne du public, montre des actions apparemment improvis\u00e9es et \u00e0 la fin du cours, r\u00e9v\u00e8le que tout ce qu\u2019il a montr\u00e9 \u00e9tait une mise en sc\u00e8ne planifi\u00e9e. Et que donc, il est n\u00e9cessaire de bien r\u00e9fl\u00e9chir \u00e0 la mani\u00e8re de pr\u00e9senter pour capter l\u2019attention du public et transmettre ses id\u00e9es. A chaque fois que je fais une pr\u00e9sentation, je repense \u00e0 ses conseils!<\/p>\n

Article : Milena Metzger & Laura De Santis.
\nUne publication de l\u2019Ecole doctorale de la Facult\u00e9 de biologie et de m\u00e9decine de l\u2019UNIL.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Parcours de Drs Alumni: 60 minutes avec Armand Valsesia Mon conseil\u00a0? Cultivez la curiosit\u00e9, et ne vous cantonnez pas \u00e0 des cours techniques ou dans votre zone de confort. Des formations sur la communication scientifique, l\u2019organisation du travail et les brevets sont utiles pour la carri\u00e8re future. Date de naissance: le 8 octobre 1981. Date … <\/p>\n

Continue reading “Armand Valsesia”<\/span><\/a><\/p>\n","protected":false},"author":3,"featured_media":1344,"parent":1246,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"template-full-width.php","meta":[],"_links":{"self":[{"href":"http:\/\/drsalumni.unil.ch\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1261"}],"collection":[{"href":"http:\/\/drsalumni.unil.ch\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"http:\/\/drsalumni.unil.ch\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"http:\/\/drsalumni.unil.ch\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/3"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"http:\/\/drsalumni.unil.ch\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1261"}],"version-history":[{"count":32,"href":"http:\/\/drsalumni.unil.ch\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1261\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":1761,"href":"http:\/\/drsalumni.unil.ch\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1261\/revisions\/1761"}],"up":[{"embeddable":true,"href":"http:\/\/drsalumni.unil.ch\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1246"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"http:\/\/drsalumni.unil.ch\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media\/1344"}],"wp:attachment":[{"href":"http:\/\/drsalumni.unil.ch\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1261"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}