![\"\"](\"http:\/\/drsalumni.unil.ch\/wp-content\/uploads\/2021\/06\/Claude-Alain-Roten-1.jpg\")
<\/figure>Bio express du Dr Claude-Alain Roten<\/strong><\/p>\n\n\n\n Photo : Philippe Krauer<\/em><\/p>\n<\/div><\/div>\n\n\n\n Parlez-nous de votre passion pour la biologie<\/strong>.<\/p>\n\n\n\n D\u2019aussi loin que je me souvienne, j\u2019ai toujours aim\u00e9 le processus scientifique. Mais c\u2019\u00e9tait aussi dans l\u2019air du temps! Je suis n\u00e9 dans les ann\u00e9es 60, on voyait \u00e0 la t\u00e9l\u00e9vision des lancements de fus\u00e9es et des astronautes marcher sur la lune. Mes premiers achats, \u00e0 l\u2019\u00e2ge de 10 ans, se sont naturellement port\u00e9s sur des livres scientifiques. J\u2019ai donc v\u00e9cu dans un contexte diff\u00e9rent de celui que nous traversons: \u00e0 l\u2019\u00e9poque, la soci\u00e9t\u00e9 ne remettait pas en question la science et la m\u00e9decine, on avait grandement besoin de scientifiques!<\/p>\n\n\n\n Et ensuite?<\/strong><\/p>\n\n\n\n J\u2019ai cristallis\u00e9 cet int\u00e9r\u00eat en pr\u00e9parant une maturit\u00e9 scientifique dans un \u00e9tablissement valaisan dirig\u00e9 par un recteur qui d\u00e9tenait une double formation en physique th\u00e9orique et en th\u00e9ologie. Il est d\u2019ailleurs devenu cardinal par la suite! (sourire<\/em>) On parlait d\u00e9j\u00e0 de biologie mol\u00e9culaire, de s\u00e9quen\u00e7age et d\u2019environnement, et j\u2019\u00e9tais tr\u00e8s int\u00e9ress\u00e9 par ce type d\u2019information. Je me suis donc tourn\u00e9 vers la biologie \u00e0 l\u2019UNIL. J\u2019ai beaucoup appr\u00e9ci\u00e9 les deux premi\u00e8res ann\u00e9es, surtout les activit\u00e9s de laboratoire et de terrain, ainsi que les cours de g\u00e9ologie en option. Lorsque bien plus tard je me suis int\u00e9ress\u00e9 \u00e0 l\u2019origine de la vie (Dr. Roten fait r\u00e9f\u00e9rence \u00e0 ses recherches en exobiologie, N.D.L.R.), cette formation en g\u00e9ologie s\u2019est r\u00e9v\u00e9l\u00e9e bien utile. Les ann\u00e9es successives, j\u2019ai poursuivi mes \u00e9tudes dans le domaine de la microbiologie, de la biochimie et de la physiologie v\u00e9g\u00e9tale, avec un int\u00e9r\u00eat particulier pour le premier. J\u2019avais aussi envie d\u2019utiliser des outils math\u00e9matiques\u2026<\/p>\n\n\n\n Et vous avez donc d\u00e9cid\u00e9 de poursuivre avec un doctorat\u2026<\/strong><\/p>\n\n\n\n Oui, pour moi, c\u2019\u00e9tait naturel. Mon choix s\u2019est port\u00e9 sur le peptidoglycane, un composant de la paroi bact\u00e9rienne. A la fin de ma th\u00e8se, j\u2019\u00e9tais impressionn\u00e9 de constater \u00e0 quel point cette mol\u00e9cule est un puissant immunomodulateur ! Je suis ensuite parti aux \u00c9tats-Unis, \u00e0 l\u2019Universit\u00e9 de Harvard, pour d\u00e9buter un postdoctorat. Je consid\u00e8re qu\u2019il s\u2019agit d\u2019une \u00e9tape importante, aussi pour perdre ses inhibitions. En effet, en provenant d\u2019une universit\u00e9 suisse, on peut penser qu\u2019on pratique une science de deuxi\u00e8me niveau. Or, en travaillant au sein de cette universit\u00e9 respect\u00e9e, j\u2019ai pris conscience des moyens dont les autres scientifiques disposaient r\u00e9ellement pour mener \u00e0 bien leurs recherches. C\u2019est alors que j\u2019ai compris que les conditions et les moyens \u00e0 disposition en Suisse pouvaient me donner la possibilit\u00e9 d\u2019en faire un jour tout autant.<\/p>\n\n\n\n Puis vous avez men\u00e9 des recherches scientifiques \u00e0 l\u2019UNIL, tout en orientant graduellement votre carri\u00e8re vers l\u2019entrepreneuriat. Parlez-nous de cette transition.<\/strong><\/p>\n\n\n\n En r\u00e9alit\u00e9, j\u2019ai cr\u00e9\u00e9 deux start-ups! Dans les ann\u00e9es 2000, j\u2019ai \u00e9t\u00e9 le co-fondateur d\u2019une entreprise proposant un outil informatique d\u2019analyse g\u00e9nomique. Il faut savoir qu\u2019\u00e0 l\u2019\u00e9poque, il \u00e9tait tr\u00e8s ardu de s\u00e9quencer l\u2019ADN, il y avait un grand risque d\u2019erreurs. Notre start-up proposait donc une solution d\u2019analyse statistique et de v\u00e9rification\/validation de g\u00e9nomes. C\u2019\u00e9tait les pr\u00e9mices de ce que nous appelons aujourd\u2019hui le data science<\/em>. Quelques ann\u00e9es plus tard, cette technologie m\u2019a \u00e9galement permis d\u2019\u00e9tudier le g\u00e9nome de 300 bact\u00e9ries et d\u2019identifier le domaine Ter, celui o\u00f9 se termine la r\u00e9plication du chromosome. C\u2019est finalement \u00e0 la fin de mon contrat avec l\u2019UNIL, que j\u2019ai fond\u00e9 ma deuxi\u00e8me start-up : OrphAnalytics.<\/p>\n\n\n\n Pouvez-vous pr\u00e9senter OrphAnalytics sous la forme d\u2019un elevator pitch?<\/strong><\/p>\n\n\n\n Notre technologie permet de r\u00e9pondre \u00e0 la question : \u00ab Qui a \u00e9crit un texte? \u00bb. Nous disposons d\u2019un logiciel capable de mesurer la syntaxe d\u2019un texte et de la comparer avec celle d\u2019autres textes. La syntaxe (autrement dit, les tournures de phrase ou le style) est un signal stable qui permet de d\u00e9terminer qui est l\u2019auteur d\u2019un \u00e9crit. Si les styles r\u00e9dactionnels sont tr\u00e8s distincts entre les textes, le logiciel va mesurer un \u00e9cart significatif, et si les styles sont tr\u00e8s proches, il va mesurer une concordance (autrement dit, une concordance indique que les textes compar\u00e9s ont tr\u00e8s probablement \u00e9t\u00e9 \u00e9crits par la m\u00eame personne). L\u2019avantage de cette technologie est son approche objective, rapide et reproductible, car il s\u2019agit d\u2019une analyse par machine learning<\/em>.<\/p>\n\n\n\n Avant d\u2019aborder les applications possibles, pouvez-vous nous expliquer l\u2019origine de votre id\u00e9e?<\/strong><\/p>\n\n\n\n Lorsque je faisais des d\u00e9monstrations avec un outil d\u2019analyse statistique du g\u00e9nome \u00e0 mes coll\u00e8gues de l\u2019UNIL, j\u2019utilisais des textes au lieu d\u2019utiliser le code ADN, ceci \u00e0 des fins purement p\u00e9dagogiques. Un jour, j\u2019ai exp\u00e9riment\u00e9 ce qu\u2019on appelle le Aha! moment<\/em>, j\u2019ai eu envie de me servir de l\u2019outil pour comparer les styles d\u2019\u00e9criture (la syntaxe) pr\u00e9sents dans diff\u00e9rents textes. Comme cela fonctionnait bien, l\u2019outil a par la suite \u00e9t\u00e9 optimis\u00e9 pour \u00eatre pleinement transpos\u00e9 au domaine de la stylom\u00e9trie, une discipline existante de la linguistique qui se destine justement \u00e0 l\u2019analyse du langage \u00e9crit et \u00e0 l\u2019authentification de textes anonymes. En r\u00e9sum\u00e9, j\u2019ai pu m\u2019appuyer avec confiance sur mon expertise dans le domaine de la g\u00e9nomique pour adapter et introduire une nouvelle technologie bas\u00e9e sur le machine learning<\/em> dans le domaine de la linguistique et de la stylom\u00e9trie.<\/p>\n\n\n\n Quelles sont les applications de cette nouvelle technologie?<\/strong><\/p>\n\n\n\n L\u2019authentification touche de nombreux domaines, principalement l\u2019enseignement, la recherche et les affaires judiciaires. Notre solution permet de rapidement d\u00e9tecter des ruptures de style ; elle se r\u00e9v\u00e8le donc efficace pour mettre en lumi\u00e8re le plagiat et les recours illicites \u00e0 des ghostwriters<\/em> pour des travaux acad\u00e9miques. Elle peut aussi \u00eatre utile \u00e0 des expertises dans le cadre d\u2019enqu\u00eates judiciaires (p.ex. l\u2019affaire Gr\u00e9gory et l\u2019analyse de lettres de menace<\/a>). Je pr\u00e9cise que dans le cadre judiciaire, nous n\u2019apportons pas de preuve, mais une analyse de proximit\u00e9 de styles. OrphAnalytics a aussi d\u00e9but\u00e9 des analyses de m\u00e9lodies et d\u2019images (dans une perspective d\u2019authentification d\u2019\u0153uvres musicales et de tableaux, N.D.L.R.) : les r\u00e9sultats pr\u00e9liminaires sont encourageants. L\u2019approche est originale, mais c\u2019est \u00e0 la fois une chance \u00e9norme et un malheur, car il faut sans cesse expliquer \u00e0 quelles questions notre solution peut apporter des r\u00e9ponses !<\/p>\n\n\n\n En quoi consiste concr\u00e8tement votre travail? <\/strong><\/p>\n\n\n\n Le cr\u00e9ateur d\u2019entreprise devient \u00e0 un moment donn\u00e9 un manager. Il y a beaucoup \u00e0 faire et je ne peux pas tout prendre en charge. Par exemple, j\u2019avais envie de faire l\u2019analyse des textes de QAnon, j\u2019ai d\u00fb trouver dans le p\u00e9rim\u00e8tre de l\u2019entreprise la personne qui avait envie de s\u2019en charger, puis m\u2019assurer qu\u2019elle avait les comp\u00e9tences et le soutien n\u00e9cessaires. Finalement, j\u2019agis comme un superviseur de th\u00e8se! (rire<\/em>) Aussi, nous pourrions viser uniquement des missions utilitaires. Mais honn\u00eatement, si je ne disposais pas d\u2019analyses m\u00e9diatis\u00e9es comme QAnon, Ferrante, ou Millenium<\/a>, comment pourrais-je pr\u00e9senter ma solution aupr\u00e8s d\u2019organisations telles que l\u2019UNIL ? <\/p>\n\n\n\n Quelles sont les comp\u00e9tences n\u00e9cessaires pour d\u00e9velopper et g\u00e9rer une entreprise?<\/strong><\/p>\n\n\n\n Cr\u00e9er une entreprise n\u00e9cessite beaucoup de comp\u00e9tences, c\u2019est donc difficile de les avoir toutes. L\u2019essentiel est d\u2019\u00eatre convaincu que le projet en vaut la peine. Je disposais \u00e0 cet effet d\u2019une grille avec plusieurs questions \u00e0 me poser, les deux principales \u00e9tant : \u00ab Vais-je avoir du plaisir ? \u00bb et \u00ab Ai-je les comp\u00e9tences scientifiques? \u00bb. Il faut le dire: c\u2019est une vie de bagne, car huit start-ups sur dix disparaissent apr\u00e8s six ans! Le plaisir est donc un aspect tr\u00e8s important \u00e0 prendre en consid\u00e9ration. Par rapport \u00e0 mes comp\u00e9tences scientifiques, j\u2019ai pu m\u2019appuyer sur 10’000 heures d\u2019expertise dans le domaine de l\u2019analyse g\u00e9nomique. J\u2019aimerais ajouter que ma d\u00e9marche n\u2019est pas celle de d\u00e9velopper une start-up pour la revendre rapidement, comme cela peut se pratiquer pour des spin-offs sortant de l\u2019universit\u00e9, mais plut\u00f4t de me payer en plaisir, contacts et projets. Je suis impliqu\u00e9 au c\u0153ur du processus, y compris en tant qu\u2019actionnaire. <\/p>\n\n\n\n Quelles valeurs souhaitez-vous v\u00e9hiculer au travers d\u2019OrphAnalytics?<\/strong><\/p>\n\n\n\n Sans doute l\u2019honn\u00eatet\u00e9 intellectuelle et l\u2019int\u00e9grit\u00e9! Selon certains experts, 10% des \u00e9tudiants frauderaient soit par ghostwriting<\/em>, soit par plagiat, soit en bricolant les r\u00e9sultats scientifiques. Actuellement, on peut obtenir des services de ghostwriting<\/em> par des professionnels \u00e0 un prix accessible. Les \u00e9tudiants faisant appel \u00e0 cela ont donc de meilleures notes pour moins d\u2019efforts : il y a donc une prime \u00e0 la fraude! L\u2019id\u00e9e est de favoriser les \u00e9tudiants honn\u00eates, en authentifiant leurs productions avec un label \u00ab textuellement transparent \u00bb (ceux-ci devraient accepter de soumettre leurs productions au logiciel delta2T). La certification des bonnes pratiques r\u00e9dactionnelles permettrait ainsi de renverser la situation et servirait de frein \u00e0 ceux tent\u00e9s par la tricherie. C\u2019est un constat : quand une personne fraude, elle va continuer sur cette voie. Il en d\u00e9coule une fragilisation des institutions: non seulement le dipl\u00f4m\u00e9 acc\u00e9dera \u00e0 des postes avec un manque de comp\u00e9tences, mais il s\u2019exposera \u00e0 des pressions ou \u00e0 un potentiel chantage. Cette pratique favoriserait les \u00e9tudiants int\u00e8gres pour acc\u00e9der \u00e0 des postes \u00e0 responsabilit\u00e9.<\/p>\n\n\n\n Entre curiosit\u00e9 intellectuelle (propre au chercheur) et recherche de nouveaux march\u00e9s (propre \u00e0 l\u2019entrepreneur), un \u00e9quilibre satisfaisant est-il possible?<\/strong><\/p>\n\n\n\n Je crois que quand vous \u00eates un chercheur, vous \u00eates un entrepreneur (et vice-versa), la diff\u00e9rence tient \u00e0 l\u2019endroit o\u00f9 vous placez le curseur. Vous l\u2019avez compris: j\u2019adore sortir de la bo\u00eete! (rire<\/em>) Chercher d\u2019autres march\u00e9s? Ce n\u2019est que du bonheur pour moi!<\/p>\n\n\n\n Si vous deviez faire la promotion de la fili\u00e8re doctorale aupr\u00e8s d\u2019\u00e9tudiant\u00b7e\u00b7s, quel argument avanceriez-vous en premier?<\/strong><\/p>\n\n\n\n Le travail de th\u00e8se permet de d\u00e9couvrir le monde de la recherche et d\u2019exp\u00e9rimenter le travail en \u00e9quipe. Au d\u00e9but, il a peu d\u2019autonomie. Mais si le doctorant a de la chance, la personne qui dirige la th\u00e8se le laissera progressivement explorer avec un plus grand degr\u00e9 de libert\u00e9, de mani\u00e8re \u00e0 ce qu\u2019il puisse r\u00e9pondre \u00e0 ses propres questionnements. Et cela prend du temps d\u2019apprendre \u00e0 formuler des questions qui vont amener des r\u00e9ponses d\u00e9cisives. Mais ce parcours est inestimable, car il est li\u00e9 \u00e0 la consolidation de l\u2019estime de soi et de la confiance, et ces ingr\u00e9dients sont n\u00e9cessaires \u00e0 une carri\u00e8re scientifique, car il faut oser sortir des sentiers battus! <\/p>\n\n\n\n![\"\"](\"http:\/\/drsalumni.unil.ch\/wp-content\/uploads\/2021\/06\/Orphanalytics.jpg\")